Geralmente não. Masterize o mix final equilibrado.
Edite stems primeiro: restauração, melhoria, volume e EQ. Exporte o mix completo quando equilibrado, reimporte e use Master na música completa.
Masterizar só um stem serve quando você quer esse processamento isolado. Não equivale à música inteira. Use masterização automática após exportar o mix pronto.
Veja o pipeline recomendado.