デクリッピング後の曲が元のマスターより小さく聴こえるのはなぜですか？

再構成したピークに余裕が必要なためです。Better DeclipperでPCM書き出しの上限を超えるピークを復元すると、音楽修復ツールはサンプルピークに0.1 dBの余裕ができるだけ全体の音量を下げます。WAV書き出し時の再クリッピングを防ぐためです。同程度の聴感音量で、ドラムのアタック、声の荒さ、パチパチ音を比較してください。小さくなっただけでは修復成功とは言えません。